Kualifikasi lulusan yang akan dihasilkan STIU Wadi Mubarak adalah:
Menghasilkan sarjana yang hafal Al-Qur’an, memiliki keahlian dalam bidang ilmu- ilmu Al-Qur'an dan Tafsir.
Menghasilkan sarjana yang ahli dalam bidang penelitian keagamaan.
Menghasilkan sarjana yang mampu mencari alternatif pemecahan masalah sosial dan keagamaan.
Menghasilkan sarjana yang mampu bekerja sama dengan lembaga-lembaga yang bergerak di bidang sosial dan keagamaan.
Rasulullah Shallallahu 'Alaihi wasallam bersabda:
“Sebaik-baik kalian adalah orang yang mempelajari Al-Qur’an dan mengajarkannya”. (HR. Bukhari).
“Sebaik-baik kalian adalah orang yang mempelajari Al-Qur’an dan mengajarkannya”. (HR. Bukhari).